Prace Józefa Majera w zbiorach Biblioteki
- Charakterystyka fizyczna ludności galicyjskiej, na podstawie spostrzeżeń dokonanych za staraniem Komisyi Antropologicznej Akademii Umiejętności w Krakowie. Kraków, 1876.
- Fizyologija układu nerwowego. Kraków, 1854.
- Fizyologija zmysłów. Kraków, 1857.
- Literatura fizyografii ziemi polskiéj. Kraków, 1862.
- Niemiecko-polski słownik wyrazów lekarskich. Kraków, 1842.
- Obraz postępu nauki lekarskiéj, o ile nań wpłynęły pisma polskie, lub przez Polaków w trzech ostatnich latach wydane. Kraków, 1840.
- Obraz postępu nauki lekarskiéj o ile nań wpłynęły prace lekarzy polskich w trzech latach ostatnich. 2, Trzylecie drugie : 1840-1842. Kraków, 1843.
- Pamiętnik pierwszego zjazdu lekarzy i przyrodników polskich odbytego w r. 1869 w Krakowie. Kraków, 1870.
- Projekt urządzenia służby weterynarskiéj w kraju Wolnego Miasta Krakowa, podany i poprzedzony historyczną wiadomością o urządzeniach rzeczy weterynarskiéj w kraju naszym dotyczących. Kraków, 1842.
- Przegląd Lekarski : organ urzędowy Towarzystwa Lekarskiego Krakowskiego i Towarzystwa Lekarzy Galicyjskich, organ Związku Polskiego Lekarzy i Przyrodników Polskich w Petersburgu oraz Towarzystw Lekarskich Polskich w Kijowie i Chicago. [nakładem Towarzystwa Lekarskiego Krakowskiego].
- Rocznik Wydziału Lekarskiego w Uniwersytecie Jagiellońskim. Kraków.
- Skutki ciśnienia powietrza pod względem fizyologicznym i patologicznym. Kraków, 1844.
- Trwanie życia w Krakowie na zasadzie wykazu zmarłych w latach 1859-1868 obliczone co do ludności chrześcijańskiéj. Kraków, 1881.
- Wpływ stanu meteorologicznego na śmiertelność : oceniony według dziesięcioletnich spostrzeżeń w Krakowie. Kraków, 1845.
- Wspomnienie o życiu i zasługach nauczycielskich W. J. Boduszyńskiego. Kraków, 1843.
- Zdanie sprawy z czynności Towarzystwa Naukowego Krakowskiego z Uniwersytetem Jagiellońskim złączonego, dokonanych w r. 1849/50 : odczytane na publiczném posiedzeniu tegoż Towarzystwa w d. 26 października 1850 r. Kraków, 1851.
- Zdanie sprawy z czynności Towarzystwa Naukowego Krakowskiego z Uniwersytetem Jagiellońskim złączonego dokonanych w r. 1848/49 : odczytane na publicznem posiedzeniu w d. 27 paźdź. 1849 r. Kraków, 1849.
- Rozbiór fizyologiczny wprawy, przyzwyczajenia. Kraków, 1850.
- Głos Józefa Majera Rektora Uniwersytetu Jagiellońskiego oraz Prezesa Towarzystwa Naukowego Krakowskiego miany na publiczném posiedzeniu tegóż Towarzystwa d. 4 listopada 1848 r. Kraków, 1848.
- Józefa Majera przemowa nad zwłokami prof. Kazim. Fryd. Skobla dnia 28 listopada 1876 roku. Kraków, 1877.